Немецкие молекулярные биологи впервые в большом масштабе проследили за прямыми контактами белков вируса гриппа А и человеческих клеток в естественных условиях заражения. Исследование позволило определить два механизма, с помощью которых патоген использует клеточные структуры для размножения. Результаты опубликованы в Nature Microbiology.
Специалисты Европейской лаборатории молекулярной биологии и их коллеги объединили масс-спектрометрию внутри клеток с моделированием структуры белков на основе AlphaFold. Новый метод позволил сохранить клетки целыми и зафиксировать кратковременные контакты, которые могли исчезать при использовании прежних способов анализа.
Исследователи обнаружили 867 контактов между участками вирусных и человеческих белков, охвативших 198 белковых пар. Первый выявленный механизм связан с гемагглютинином — поверхностным белком, необходимым вирусу для проникновения в клетки. Клеточные белки помогали ему правильно складываться, модифицироваться и перемещаться через внутреннюю транспортную систему.
Второй механизм затрагивает параспеклы — небольшие безмембранные структуры внутри клеточного ядра. При заражении они разрушались, высвобождая РНК-связывающие белки, которые вирус мог использовать для копирования своего генетического материала. В EMBL считают, что открытие поможет искать новые мишени для разработки лекарств и вакцин.