Согласно исследованию, представленному на Международной конференции ATS 2021, наличие вариантов генетического риска в гене ABO может значительно увеличить риск развития COVID-19.
Многое о COVID-19 остается медицинской загадкой, в том числе о том, повышают ли определенные гены людей риск заражения вирусом SARS-CoV-2, который вызывает COVID-19. Ана Эрнандес Кордеро, доктор философии, научный сотрудник Центра инноваций в области сердца и легких Университета Британской Колумбии, и ее коллеги использовали интегративную геномику в сочетании с протеомикой для идентификации этих генов.
В геномных исследованиях выявляются определенные гены, которые могут играть роль в биологических процессах, таких как развитие болезней, а протеомика делает то же самое для белков. Исследователи могут получить более полную картину процессов болезни, интегрировав инструменты для исследования обоих.
Исследователи объединили генетическую информацию с исследованием экспрессии генов в легких, чтобы определить генетические варианты, которые контролировали экспрессию генов в легких, ответственных за COVID-19. Исследователи определили маркеры конкретных генов, которые влияют на экспрессию генов и уровни белка с восприимчивостью к COVID-19. Для анализа они использовали биоинформатику для интеграции: наборы геномных данных, полученных от пациентов, инфицированных SARS-CoV-2, а также от неинфицированных лиц; наборы данных по экспрессии генов в тканях легких и крови из клинических популяций (не COVID-19); и набор протеомных данных, полученных от доноров крови (не COVID-19).
Таким образом, они обнаружили, что несколько генов, ответственных за реакцию иммунной системы на COVID-19, также вовлечены в восприимчивость к COVID-19. То, что они обнаружили, было подтверждено результатами предыдущих исследований.
В поисках генов-кандидатов в белках крови они смогли сделать еще один шаг в соединении эффектов генов с восприимчивостью к COVID-19. Протеомика крови также может помочь идентифицировать маркеры в крови, которые можно легко измерить, чтобы указать статус болезни и, возможно, контролировать болезнь.
«Используя возможности геномной информации, мы идентифицировали гены, связанные с COVID-19», — сказал доктор Эрнандес. «В частности, мы обнаружили, что ген ABO является значительным фактором риска COVID-19. Особо следует отметить взаимосвязь между группой крови ABO и риском COVID-19. Мы показали, что эта взаимосвязь является не просто ассоциацией, а причинно-следственной».
Помимо гена ABO, доктор Эрнандес и его коллеги обнаружили, что люди, несущие определенные генетические варианты SLC6A20, ERMP1, FCER1G и CA11, имеют значительно более высокий риск заражения COVID-19. «Эти люди должны проявлять особую осторожность во время пандемии. Эти гены также могут оказаться хорошими маркерами болезни, а также потенциальными мишенями для лекарств».
Некоторые из генов, выявленных в ходе анализа исследователей, уже связаны с респираторными заболеваниями. Например, ERMP1 был связан с астмой. CA11 также может повышать риск COVID-19 для людей с диабетом.